מרחב אגני ההיקוות והנחלים הוא אחד מהמרחבים האחרונים המשמשים כשטח פתוח מוגן בישראל, מדינה צפופה הנמצאת בתהליכי פיתוח ובנייה מסיביים. כל מרחב נחל מהווה מערכת המרכזת בשטח קטן מגוון רחב של בעלי עניין ואינטרסים. אחד הקשיים העיקריים הקיימים בתחום אגני ההיקוות והנחלים בישראל הוא אופיו המבוזר של התחום: לכל אגן היקוות קיימות תוכניות ודרכי פעולה נפרדות, ללא תיעוד מסודר ובאווירה של ריבוי בעלי עניין המייצרים את המסגרת הניהולית של השטח.
קיימת תורה שבעל פה ענפה ועשירה, אלא שהיא נמצאת בידיהם של מומחים בודדים ואיננה משותפת עם בעלי עניין אחרים. במקביל ידע ונתונים המופקים על ידי גורמי מחקר ומחוץ לתחום אינם מגיעים לשחקנים השונים בצורה קבועה, ממוסדת וסדירה. נראה כי חוסנם של מרחבי אגני היקוות ונחלים הדרוש לתפקודם בימי שיגרה וחירום (כמו הצפות ושיטפונות) תלוי בין היתר ביצירת שפה משותפת בין כלל בעלי העניין והטמעת ידע עדכני ומתחדש המותאם לקהלים השונים.
הצורך הקיים בריכוז הידע, מיפוי הפערים הקיימים, יצירת שפה משותפת לכלל בעלי העניין ולהבאת הידע לקהילה המקצועית ולמקבלי ההחלטות, בצורה נגישה, ברורה וזמינה הביא להקמת אגמא - המרכז לאגני היקוות ונחלים.
מרכז אגמא הוקם על מנת לאפשר מפגש ויצירת קהילה מקצועית לומדת בקרב כלל העוסקים במרחבי אגני ההיקוות והנחלים בישראל. המרכז יפעל להטמעת הגישה האגנית המשלבת (האינטגרטיבית) בארץ לצד איסוף וריכוז ידע רלוונטי, עדכני ומקצועי מהארץ ומהעולם כדי להעשיר ולאפשר למעגלים רחבים של בעלי עניין ללמוד ולייצר סביבה אגנית בריאה ומיטיבה עבור כולם.
מרכז אגמא הינו שותפות של משרד החקלאות, המשרד להגנת הסביבה, רשות הטבע והגנים, רשויות ניקוז בישראל, האגודה הישראלית לאקולוגיה ולמדעי הסביבה ויד הנדיב.